Na ação penal o Nucleos é Assistente do Ministério Público.
Em 31 de dezembro de 2016, o Instituto possuía 127 processos jurídicos, divididos conforme a natureza da ação: cível, tributária, penal e trabalhista.
No primeiro gráfico apresenta-se a distribuição das ações em que o Nucleos é o autor: 85 cíveis, 7 tributárias e 1 penal.
No segundo gráfico mostra-se a distribuição das ações em que o Nucleos é o réu: 26 cíveis, 5 tributárias e 3 trabalhistas.